Le Panerys Vilnius est un club de football semi-professionnel lituanien basé à Vilnius. Il évolue en deuxième division lituanienne, la 1 Lyga.
Le club a été fondé en 1963 sous le nom de Žalgiris-2 Vilnius, en tant qu'équipe réserve du FK Žalgiris Vilnius. En 1990, il devient indépendant et prend le nom de Panerys Vilnius.
Le Panerys Vilnius a remporté la Coupe de Lituanie à deux reprises, en 1992 et 1995. Il a également terminé deuxième du championnat de Lituanie à deux reprises, en 1992 et 1993.
Le club est connu pour sa formation de jeunes joueurs, qui ont souvent rejoint les rangs de l'équipe nationale lituanienne. Parmi les joueurs notables passés par le Panerys Vilnius figurent Edgaras Jankauskas, Deividas Šemberas et Marius Stankevičius.
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